
بعد از گریختن از سیاره بیگانگان، سفینه ی «الن ریپلی» هم در آن است، در یک معدن سقوط می کند. ریپلی می فهمد که یک موجود بیگانه که بطور مخفیانه وارد سفینه شده، علت سقوط بوده است. این موجود بیگانه شروع به کشتن ساکنان معدن می کند، اما ریپلی نمی داند که دشمن اصلی او چیزی بیشتر از این موجود بیگانه است.

يك فدراسيون سياره اى ، نمايندهاى به نام « كلاتو » ( رنى ) را همراه با روبات بزرگى به نام « گورت » به زمين مى فرستد تا به مردم زمين درباره ى آزمايشهاى هسته اى ويرانگرشان هشدار دهند . سربازى امريكايى به وحشت مى افتد و به سوى « كلاتو » شليك مى كند . اما « كلاتو » مانع از آن مى شود كه « گورت » زمين را نابود كند...

بيماري مسري مرموزي دنيا را تهديد مي کند. روان پزشکي اهل واشينگتن به نام «کارول بنل» (کيدمن) ريشه ي اين بيماري را در موجودات فضايي کشف مي کند و در مي يابد که تنها راه نجات بشر از شر بيماري در وجود پسرش (باند) است. او به کمک همکارش «بن دريسکول» (کريگ)، بايد راهي براي درمان اين بيماري پيدا کند پيش از اين که همه ي دنيا نابود شود....

قسمت دوم فیلم بیگانه، داستان سفر پرمخاطره گروهی از پیروان مذهب تائو در زمان و فضا برای یافتن شمشیر الهی را روایت میکند. آنها با عبور از گذرگاههای زمان و سرزمینهای ناشناخته، با چالشها و دشمنان متعددی روبرو میشوند. اما ایمان، شجاعت و مهارتهای آنها، راه را برای پیروزی و دستیابی به شمشیر الهی هموار میکند. با به دست آوردن این شمشیر، پیروان تائو قدرت و توانایی لازم برای برقراری صلح و عدالت در جهان را پیدا میکنند.