انحراف فاجعه‌بار یک قطار، شهر را به هرج و مرج می‌کشاند. اما این فقط آغاز است. حمله گاز بیولوژیکی، بازماندگان سانحه قطار را در عرض چند دقیقه به کام مرگ می‌کشاند. و این بیماری به سرعت در حال گسترش است.
توماس و بی اکنون ازدواج کرده و با پیتر و خانواده خرگوشش زندگی می کنند. پیتر که از زندگی در باغ خسته شده، به شهری بزرگ می رود، جایی که با شخصیت های مرموز ملاقات می کند و در نهایت برای خانواده هرج و مرج بوجود می اورد...
«سوپرمن» بعد از نبردی با «ژنرال زاد» که منجر به نابودی سیاره اش کریپتون، تلاش می کند تا دریابد غیر از خودش کس دیگری نیز نجات یافته است یا خیر. به همین دلیل شش سال از دنیا دور می می ماند. زمانی که باز می گردد درمی یابد که دنیا به قهرمانی چون او دیگر نیازی ندارد و محبوبش «لوا لین» نیز در غیاب او صاحب معشوق و زندگی تازه ای شده است. همزمان دشمن قدیمی او، «لکس لاتور» شیطان صفت نیز که به تازگی از زندان آزاد شده، سرگرم طراحی نقشه های پلید تازه ای است. سوپرمن برای نجات دنیا و به چنگ آوردن عشق محبوب پیشین خود ناچار به مبارزه در دو جبهه می شود.
