داستان فیلم یکسال پس از وقایع قسمت نخست که طی آن لاکپشت های نینجا اجازه ندادند ویروس مرگبار توسط "شریدر" در نیویورک منتشر شود، رخ می دهد. خبر می رسد شریدر توانسته از از چنگال قانون بگریزد. وی پس از فرار از زندان به سراغ یک دانشمند دیوانه به نام استوکمن می رود تا با استفاده از قابلیت های او، تعدادی هیولای کله گنده برای پیشبرد اهدافش خلق کند...
"نیک" شهردار جوانی است که در منطقه یانکرز نیویورک زندگی می کند. جایی که وضعیت اقتصادی نابه‌سامانی دارد و اختلاف نژادی در آنجا موج می زند. دولت به او ماموریتی می دهد که آینده سیاسی او را به خطر می اندازد. او مجبور به ساخت خانه هایی در محله سفید پوستان می شود و...
بث یک حافظ منابع طبیعی است که به دنبال یه کار خوب و دوستان خوب و یه پسر خوب میگرده تا اوقاتش را بگذرونه ….
سوپر قهرمان لاابالي و الکلي لس آنجلس، «جان هنکاک» (اسميت) اگرچه جان بسياري را نجات مي دهد، اما باعث خرابي هاي بسياري نيز مي شود. تا اين که مردي به نام «ري امبري» (بيتمن) که هنکاک جانش را نجات داده تصميم مي گيرد که تغييري در ظاهر، رفتار و اصلا روابط عمومي سوپر قهرمان به وجود بياورد...
فیلمی درباره "مارک دیوید چپمن" در روزهایی که منتهی به قتل مشهور یکی از اعضای گروه بیتل "جان لنون" می شود...